MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 chromosome

Total Repeats: 25361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012658	TAG	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012658	T	7	7	12	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012658	T	7	7	54	60	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012658	CAA	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012658	ATAA	2	8	80	87	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012658	TA	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012658	GTT	2	6	98	103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012658	GGA	2	6	151	156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012658	TAA	2	6	1531	1536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012658	TTAT	2	8	1541	1548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012658	TTG	2	6	1549	1554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012658	ATT	2	6	1627	1632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012658	CAA	2	6	1684	1689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012658	CTA	6	18	1693	1710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012658	TAT	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012658	TCTATT	2	12	1724	1735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012658	TAA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012658	AGG	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012658	TA	3	6	3108	3113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012658	AAT	2	6	3121	3126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012658	A	6	6	3134	3139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012658	TAT	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012658	TAAT	2	8	3150	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012658	AGG	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012658	ATA	2	6	8987	8992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012658	TCTT	2	8	9016	9023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012658	A	6	6	9042	9047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012658	ATAA	2	8	9079	9086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012658	AGA	2	6	9100	9105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012658	ATA	2	6	9149	9154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012658	A	6	6	9230	9235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012658	AAC	2	6	9249	9254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012658	GGC	2	6	9432	9437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012658	CTTC	2	8	9469	9476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012658	GCG	2	6	9490	9495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012658	ATA	2	6	9568	9573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012658	T	7	7	9590	9596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012658	GGTAA	2	10	9645	9654	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012658	GCA	2	6	9742	9747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012658	GCA	2	6	9782	9787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012658	CGC	2	6	9789	9794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_012658	TGA	2	6	9800	9805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012658	AGG	2	6	9858	9863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012658	CAG	2	6	9885	9890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012658	GAA	2	6	10077	10082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012658	GGC	2	6	10096	10101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012658	AGC	2	6	10305	10310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012658	GAA	2	6	10340	10345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012658	GGT	2	6	10413	10418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012658	GTC	2	6	10427	10432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012658	TCGTG	2	10	10436	10445	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012658	TTA	2	6	10484	10489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012658	AGG	2	6	10537	10542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012658	ATC	2	6	10562	10567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012658	AC	3	6	10589	10594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012658	GGTA	2	8	10605	10612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012658	AC	3	6	10758	10763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012658	CCT	2	6	10899	10904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_012658	AGAA	2	8	10918	10925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012658	TTCT	2	8	10931	10938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012658	GA	3	6	10965	10970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012658	TC	3	6	10975	10980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012658	GAA	2	6	11172	11177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012658	TAT	2	6	11271	11276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012658	GGA	2	6	11335	11340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012658	AGAA	2	8	11343	11350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012658	GCG	2	6	11369	11374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012658	AGA	2	6	11435	11440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012658	ACC	2	6	11571	11576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012658	TAC	2	6	11590	11595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012658	GGA	2	6	11885	11890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012658	CGT	2	6	11998	12003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012658	TAG	2	6	12048	12053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012658	TAAGT	2	10	12174	12183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012658	AGC	2	6	12230	12235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012658	ACC	2	6	12309	12314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012658	AAGCT	2	10	12664	12673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012658	AGGT	2	8	12773	12780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012658	GAG	2	6	12781	12786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012658	GAA	2	6	12805	12810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012658	CGG	2	6	13028	13033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012658	TGCT	2	8	13160	13167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012658	ACC	2	6	13299	13304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012658	CGG	2	6	13327	13332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012658	CCT	2	6	13387	13392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_012658	CG	3	6	13440	13445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012658	GGT	2	6	13523	13528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012658	TCG	2	6	13638	13643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012658	CGT	2	6	13718	13723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012658	GAG	2	6	13767	13772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012658	GAA	2	6	13942	13947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012658	TAA	2	6	14004	14009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012658	AAAT	2	8	14026	14033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012658	GA	3	6	14049	14054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012658	A	7	7	14061	14067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012658	A	7	7	14093	14099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012658	CCA	2	6	14315	14320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012658	CCA	2	6	14394	14399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_012658	T	7	7	14437	14443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012658	A	6	6	14454	14459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012658	ATA	2	6	14481	14486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012658	ATT	2	6	14491	14496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012658	TAA	2	6	14498	14503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012658	TAA	2	6	14510	14515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012658	TA	3	6	14521	14526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012658	GGT	2	6	15018	15023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012658	ATA	2	6	19408	19413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012658	T	6	6	19468	19473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012658	ATA	2	6	19498	19503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012658	TA	3	6	19508	19513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012658	AATT	2	8	19517	19524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012658	AGG	2	6	21741	21746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012658	TTA	2	6	22165	22170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012658	TA	3	6	22220	22225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012658	AG	3	6	22234	22239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012658	TAA	2	6	22258	22263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012658	AG	3	6	22329	22334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012658	T	7	7	22401	22407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012658	ATTAT	2	10	22408	22417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012658	TATT	2	8	22445	22452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012658	AATA	2	8	22462	22469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012658	ATT	2	6	23764	23769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012658	TA	4	8	23784	23791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012658	TTTAA	2	10	23792	23801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012658	ATTAA	2	10	23812	23821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012658	TAT	2	6	23851	23856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012658	TAAA	2	8	23861	23868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012658	TATTT	2	10	23884	23893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012658	TAA	3	9	23904	23912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012658	TAA	2	6	24004	24009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012658	GA	3	6	24035	24040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012658	TC	3	6	24114	24119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012658	T	7	7	24263	24269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012658	ACT	2	6	24281	24286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012658	ACTA	2	8	24301	24308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012658	AAATG	2	10	24392	24401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012658	ATTT	2	8	24419	24426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012658	AGATTT	2	12	24434	24445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012658	ATAA	2	8	24457	24464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012658	AT	3	6	24473	24478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012658	AT	3	6	24483	24488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012658	TTA	2	6	24507	24512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012658	A	6	6	24533	24538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012658	GA	3	6	24543	24548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012658	TC	3	6	24622	24627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012658	TA	3	6	24637	24642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012658	TAT	2	6	24775	24780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012658	AT	3	6	24815	24820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012658	ATAA	2	8	24904	24911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012658	A	6	6	25829	25834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012658	ATAAG	2	10	25851	25860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012658	ATT	3	9	25864	25872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012658	CAA	2	6	25890	25895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_012658	TAAA	2	8	27567	27574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012658	TTA	2	6	27595	27600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_012658	ATT	2	6	27988	27993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012658	TAT	2	6	27999	28004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_012658	TCGTG	2	10	43477	43486	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
286	NC_012658	TTA	2	6	43525	43530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_012658	ATC	2	6	43603	43608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_012658	GGTA	2	8	43646	43653	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
291	NC_012658	AC	3	6	43799	43804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
292	NC_012658	CCT	2	6	43940	43945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_012658	AGAA	2	8	43959	43966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012658	TTCT	2	8	43972	43979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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431	NC_012658	TA	3	6	54077	54082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_012658	TA	3	6	54086	54091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_012658	AATG	2	8	54111	54118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012658	GAA	2	6	54141	54146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_012658	ATT	2	6	54162	54167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_012658	T	6	6	54225	54230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_012658	GTT	2	6	54256	54261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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